南司房是负责锦衣卫内部的机构，是朱由检改革卫所制的尝试。
    但是锦衣卫作为皇帝的耳目，怎么可能只需要做好内部管理呢？
    在将南镇抚司改为南司房之后，朱由检又对锦衣卫最重要的对外机构北镇抚司进行调整：
    “北镇抚司专理诏狱职责不变，以后改为刑狱司，仍旧独立办公。”
    “刑狱司设狱政处、理刑处、侦查处、教育处、卫生处等部门，要全面改善形象，不要再酷刑杀人。”
    “卫生处负责诏狱的医疗卫生工作，以后诏狱的卫生状况要不定期检查。犯人若是死亡，要查清楚原因、追究相关责任。死刑由大理寺复核，不得在诏狱妄杀。”
    “教育处负责犯人的文化需求，诏狱的犯人大多是官员，要让他们接受教育，认识到自己的错误。如果有人想写什么，也可以让他们写，审查后再做处理。”
    “侦查处负责侦查狱内案件、排查安全隐患，防止有人在狱内作案。如果有犯人提供新证据、新线索，也要即使联系侦缉总队进行侦查，酌情优待犯人。”
    “理刑处负责刑狱惩罚，尽量使用关禁闭等非肉体惩罚，不得随意伤残犯人肢体，不得长时间连续惩罚。卫生处要定期对犯人体检，查看伤病情况，追究伤病原因。”
    “狱政处负责犯人管理，罪犯收押、释放、探视、移交等等，都归狱政处负责。”
    “最后再设个办公室，负责刑狱司的公文、档案、财务等日常事务。”
    设置好了部门，朱由检又吩咐道：
    “南司房把这些记下来，人事厅负责诏狱编制调整。让刘侨尽快上任，对诏狱进行整顿。”
    “尤其是要查清诏狱情况，把不该由诏狱羁押的罪犯，全部移交刑部和大理寺，不要一直放在诏狱里。”
    “诏狱要全面清理，彻底清查旧案，该杀头的就杀头，该流放的就流放，争取把诏狱完全清空，打扫整修一遍。”
    清空诏狱是会被人夸赞为明君的举措，朱由检要夺回锦衣卫的控制权，不能不做好形象工作。
    戚昌国、李顺祖领命，又对北镇抚司只设置五个处有些不敢相信，询问道：
    “刑狱司下直接设处，应该定为几品？”
    朱由检明确回应：
    “司是正五品，处是正七品，下面是否设科股要看具体需要。”
    “司长、处长的品级，可以通过加衔提升。”
    这下众人都明白了，皇帝在把南镇抚司提升为南司房后，没有把北镇抚司同样提升为北司房，实际是做了降级。
    南司房下辖的厅是正六品，刑狱司下辖的处只是正七品。而且南司房提督是指挥，刑狱司是否由指挥提督还不一定，以后可能只是个普通的五品部门。
    由此可见，皇帝并不重视诏狱，没打算用诏狱实现什么目的。
    这让一些锦衣卫官员心中哀叹，知道碰上了一个不重视诏狱的皇帝。
    也有一些人心中高兴，知道这样就不用和文官产生剧烈冲突，能够平平安安。
    朱由检不管他们怎么想，他是没打算随便杀人的。每个官员在他看来都有用处，只要不犯下必死的罪过，流放去海外当军户也能产生价值，完全没必要杀。
    诏狱以后的用途，并不是酷刑杀人，而是羁押外廷没资格处理的官员，回归最初职能。
    相对来说，朱由检更担心诏狱的狱卒胡来，败坏自己形象。
    所以他对北镇抚司做出的安排，主要是改善管理，改善对外形象。不能让人一提起锦衣卫，就想到北镇抚司酷刑。
    因为这個，他连北镇抚司的名字都改了，以后就成了刑狱司。
    从此以后，锦衣卫要转变职能，和以前的形象说再见！
    除了诏狱之外，锦衣卫最重要的工作就是侍卫。朱由检简单分为宫内侍卫司和侍卫总队、宫外警卫司和警卫总队，负责不同的护卫工作。以后从勋贵和世官中，挑选信任的人提督。
    如此一来，锦衣卫就有了四大总队：侍卫司侍卫总队、警卫司警卫总队、东司房侦缉总队、西司房巡捕总队，一共四支武装。
    对这些武装力量的编制，朱由检同样做出调整：
    “小旗上面设小队，再往上设中队、大队。每个上级编制下辖三到五个下级编制。”
    “每个小旗是十人，小队三十人左右，中队百人左右，大队三百人到五百人。”
    “总队根据需要统辖不同的大队，如果人数过多、任务过重，可以分出独立的分队、支队。”
    “总队负责行动，各司可根据需要设置办公室、指挥处、行动处等部门，负责日常管理和行动指挥。”
    在这里只是简单提及，朱由检打算亲手做出调整。毕竟是京城的武装力量，关系到自己安全，再怎么重视都不为过。
    京城巡捕营、五城兵马司等机构，他也同样想做出改变。
    这些以后再提，接下来就是最重要的机构，也是朱由检规划的锦衣卫重点工作方向：
    “设立北司房情报中心，以锦衣卫指挥提督，单独铸造关防大印。”
    “设置统计司，统计各种数据，例如文武官员数量、每年需要的俸禄数量、税收数量、粮食产量、百姓户口数量、百姓所拥有的田亩数量等等，都要统计出来。数据来源包括官府的公开数据和锦衣卫自己搜集的数据，每年编撰统计年鉴，经过保密处理后发行。”
    “设置保密司，负责保密通讯。保密一厅负责秘密通讯，例如银章密奏在宫外的传递，在各驿站规划好传递路线，划分保密级别和加急级别，以及紧急情报需要采用的飞鸽传书等方式；保密二厅负责朝堂公文保密，为朝堂公文划分不同的保密级别，监督官员执行；保密三厅负责密码暗语的制定和破译；保密四厅负责锦衣卫内部工作保密；保密五厅负责卫所情况、军队编制等军事机密保密；保密六厅负责审查民间书籍、文字，向相关部门提议收缴涉密文书，避免被内外敌人获取。”
    “设置军事情报司简称军情司，负责军事情报。军情司要配合保密司做好军事保密，并监督各地卫所、军队动向，防止有人非法调动军队。文武官员和勋贵涉及军事的，军情司也可监督。军情司下设测绘厅、舆图室，专门绘制地图，包括地形、地貌、历年气候，以及军队驻扎地点、驻防关隘、己方和敌方可行军的路线，水运、海运航道，历年水文信息等；战略情报厅，负责根据情报分析敌人战略意图和可能战斗方向，掩盖己方战略意图，做好战略欺骗；战术情报厅，分析敌人战术、己方战术，针对性提出建议；战役情报厅，搜集战役战斗信息，分析具体交战情况，核实军功；装备情报厅，分析敌人装备、己方装备，提出装备建议；边防情报厅，负责边疆防御情报，分析外敌和可能产生的外敌，交给对外情报机构。”
    “设置对外情报司简称外情司，专门针对外敌，搜集外敌的一切信息。目前主要针对后金、草原、朝鲜以及长城沿线，收集他们的人口、钱粮、物价、地理等公开信息，以及军队编制、士兵数量、高层将领、军队调动、后勤状况等机密信息。同时负责收集西域、南洋和海外各国的公开情报，以后还要派出武官出使。”
    “设置对内情报司简称内情司，专门针对内敌，搜集各地民乱、叛乱等内部敌人信息，搜集有实力叛乱的土司、地方大族、流民聚集点信息，防止他们造反。涉及到谋逆造反的案件，内情司都可以参与，其他部门配合。如果有谋逆案件未察觉，内情司要担责。”
    “设置官员贵族情报司简称官情司，专门针对官员贵族等有品级的人员。尤其是正三品以上文官和总兵以上武将，他们的同族、同乡、同年、亲戚、好友等关系网络，都要探查出来。各地藩王宗室动向、勋贵动向和关系网络，也由官情司负责。以公开信息为主，必要时可派出间谍，查探机密信息。”
    “设置秘密情报司简称密谍司，负责秘密情报。密谍一厅负责培训间谍人员，配合各部门需要安插专业间谍。密谍二厅负责自主安插间谍，长时间静默、只负责重大情报。密谍三厅负责在敌人内部秘密发展间谍，做好策反工作。密谍四厅负责间谍工作改进，采用单线联络、加密通讯等方法，尽量保障谍报人员安全，确保不会因为间谍人员背叛，对谍报工作造成重大损失。”
    “设置反间谍情报司简称反谍司，负责反间谍工作。配合保密司做好保密，打击为敌人服务的间谍。对涉及机密信息的可疑人员进行监视，尤其是外国使者商人，以及和外国有经济贸易等利益往来、可能泄露情报的人员。”
    “设置经济技术情报司简称经情司，负责收集经济贸易情报和各行业技术情报，下设农业厅、工业厅、矿业厅、商业厅、钱法厅等部门，打击经济犯罪，尤其是制造假币和非法集资、非法开设银行钱庄等行为，发现后提交给相关部门处置。”
    “设置舆论情报司简称舆情司，负责查探舆情民意，以及各种思想动向，尤其是集会结社、宗教传播、祥瑞灾异、谶纬民谣等情况。凡是传播量达到五百次的信息，都要注意搜集，分析源头和传播动向，并根据危害性决定是否用其它信息混淆舆论、或者让行动部门羁押人员阻断信息传播。舆情司要秘密发行一些报刊书籍，暗中引导舆论。”
    一口气设置了十个司，甚至还直接设置了下属的厅，朱由检最后嘱咐道：
    “其它没涉及到或新出现的情报工作，暂时由北司房情报中心负责，以后分配给各情报司或新设情报司。”
    “情报中心负责收集、整理各方情报，及时传送御前。”
    “每日早晚都要有情报简报送达，根据重要性排列先后。”
    “如果朕做出批示，要进行重点侦查和后续追踪。”
    “每月还要进行情报汇总，把一些可以小范围公开的情报传给朝堂大臣。”
    这下所有的锦衣卫高层都明白了，以后的锦衣卫主要工作，要从诏狱转向情报。
    毕竟北司房下辖十个司、司下还要设厅，部门之多连拥有五个厅的南司房都远远比不上，更别说只有一个总队的东司房和西司房了。
    提督北司房的指挥，简直比提督东司房的锦衣卫掌印还重要。
    不过朱由检也没忘记东西司房，而且明确限制了北司房的权力，避免情报部门膨胀：
    “北司房主要负责情报，行动工作由东司房侦缉总队和西司房巡捕总队负责，和朝廷部门的联络由相关人员出面。”
    “各司要做好分工，也要做好协调。锦衣卫指挥联络统筹，要有大局观念。”
    “北司房提督由锦衣卫指挥使郑士毅兼任，配合南司房做好情报中心组建，以后从各司司长选拔指挥佥事协理。”
    这让郑士毅有些欣喜，觉得接受皇帝任命极为正确。要不然他怎么能当上锦衣卫掌印、提督东司房和北司房：
    “每日早晚上交情报简报，意味着天天都能和陛下交流。”
    “以后还需要什么东厂，我们锦衣卫直接对陛下负责。”
    正在这样想着，朱由检似乎想起了什么，又下令道：
    “再设置一个独立的监察司，仿照都察院四大总署，设置廉政处、审计处、检察处、调查处，负责锦衣卫内部监察和刑名事务。”
    “朕会派太监提督监察司，派内臣在四个处常驻。”
    “还有锦衣卫需要的银钱，都要从顺天银行等内廷控制的银行划拨，做好保密工作。”
    这个决定一出，锦衣卫高层心中哀叹，知道锦衣卫还是要受太监监督、逃不过太监制约。