百官一看万历帝发怒了，就全部拜倒在地齐声说道：「陛下息怒！臣等有罪！」..
万历帝扶着御案站起身来大声说道：「朕不知道你们吵来吵去是为什么？但是朕知道一件事，就是参与到整件事情当中的人，报错往人犯当中塞白鸭到伏击锦衣卫指挥使！这些事情已经成功的激怒朕！凡是参与到这一系列事情当中的人都要依律治罪！现在谁反对，站起来大声跟朕说！」
跪在地上的勋贵在徐希皋的带领下立刻大声表示赞同。其他文官们知道已经彻底激怒了万历帝，无奈之下也只能是以沉默表示不赞同，但是站起来的人却是一个都没有！
万历帝冷冷的扫视百官一番，见没有人敢站出来反对就直接说道：「既然没人反对那就是都赞同了！那就这么办！内阁下旨给武宁侯，让他对参与其中的人一律严办！」
这时跪倒在地的申时行一个劲儿的给张瀚悄悄的打手势，示意他起来说话。张瀚当然知道申时行的意思，但是他可不想触万历帝的霉头！
不过有一点让他无奈的是，他在内阁当中的名声一向不好，素来有「泥塑阁老」的称呼，这让几个有作为的阁老都瞧不上他！以前有张居正护着他的时候还说得过去，可是如今张居正身亡，他在内阁的地位就十分的尴尬了！
他知道申时行几个人早就琢磨着把他踢出内阁，好换一个能干的人上来。所以为了保住自己的位置，还能让自己风光几年，由于半天后他不得不起身说道：「陛下既然已经决定此事严查，那么臣等必定遵循！不过此事牵扯到的官员士绅极多，所以臣觉得此事应由刑部接手为好！毕竟刑部人手众多，经验丰富，由他们来查案必定万无一失！」
申时行看到张瀚理会到了自己的想法，还给出了充足的理由，不由得暗自点头，觉得这个「泥塑阁老」还是有些用处的！而其他文官们听到张瀚的话也是心中暗喜，都觉得他不愧是在内阁中的老油条，这一手连削带打非常的漂亮！
只要把这件案子转到刑部，那就是等于进了文官的地盘！如何处置就好说了！到时候杀一些罪行严重的作为交代也就可以了，至少能保证江南元气不失！若是锦衣卫之劫查下去，这江南的天就要变了！..
有了张瀚开头，其他官员们也纷纷跟进，这个表示锦衣卫自查容易出现漏网之鱼，应该交给刑部严查！那个说锦衣卫对江南并不熟悉，难免会出现冤假错案，应该由刑部出人进行处理！还有人干脆说锦衣卫是事件的参与者，应该避嫌，所以案子一定要交给刑部！最后没得说了，居然说锦衣卫人手根本不足，而且良莠不齐，经常搞些指鹿为马的事情，只有交给刑部才能放心云云！
总之，文官们就是想把这次判案的权利彻底拿到自己手中。不过万历帝根本不理会他们的说法，他直接抓起御案上的玉如意连敲两下，让所有人都安静下来。之后说道：「怎么？锦衣卫就查不了案吗？锦衣卫本身就是为了稽查百官而存在的，现在你们说他们查不了案，交给你们处理！难道锦衣卫贪赃枉法，你们刑部就不贪赃枉法了吗？那这么多白鸭是谁送到京师来的？是谁发现的？江南一地糜烂成这个样子，刑部怎么不说一句话？」
随后万历帝又把这些官员们痛骂了一顿。不过申时行等人并不着急，他们对事情的走向是有一定把握的！即使是不能全盘接手整个案子，但是插手其中也是做得到的！所以现在让万历帝发发脾气泄泄火也是无所谓的！
可是万万没想到的是，万历帝的下一句话却把他们吓得魂飞魄散！因为万历帝完人之后喘息几下，才从喉咙里挤出一句话来说道：「传旨，从丰台大营调新军一万赶往江南，听从武宁侯调遣！」
这句话一出勋贵愕然的呆立不动，随后就是狂喜！而文官们则如同被
蝎子蛰了一样，全部不顾礼仪的从地上跳起来大声反对！甚至有人还往御案方向涌过去！不过他们刚冲过来几步，御座两侧充当仪仗的十几个锦衣卫立刻冲了过来，用自己的身体形成一道人墙，将万历帝和百官们隔开！
万历帝站在御座前面，被忽然涌过来的人潮和他们狰狞的表情吓了一跳！「扑通」一屁股坐在龙椅上！也幸亏锦衣卫冲过来的及时把朝臣们拦住，这才让他安下心来！.
随后他觉得额头发凉，伸手一摸全是冷汗！他这是被人吓到了！所以他立刻从心底深处涌出一股屈辱感来！他是身为皇帝却被一群臣子吓得栽倒在龙椅上，这简直就是一种屈辱！
而申时行他们也看到了这一幕，也不由得心下大惊！暗自埋怨这些同僚们做事不顾后果！他们这么一闹恐怕会起反作用！而其他阁老们也意识到了这个问题，立刻开始安抚官员！而勋贵则趁机闹事儿，聚拢在御座前面做出一副忠心耿耿保护皇帝的样子！结果好好的一个早朝硬生生的变成了一个比菜市场都喧哗的地方！
有着锦衣卫的遮蔽，万历帝很快就平静下来！他恶狠狠的瞪着文官们，而文官们也觉得事情不妙，陆陆续续的跪下请罪！大殿里面总算是安静下来！
不等到所有人都安静下来，王锡爵已经抢先一步躬身说道：「陛下，诸位大臣们也没有什么其他的想法，只是一时情急而已，还请陛下恕罪！」
万历帝咬着牙说道：「不恕罪又能怎么样？朕难道还敢将你们所有人都打入大牢不成？」
听到万历帝这句话，申时行等人心里都是一沉！他们知道这次将万历帝得罪狠了，以后会有些麻烦！但是此时他只能同百官一起整齐的磕头说道：「臣等有罪！陛下息怒！」